单位绩效扣税的程序如下：
确定全年一次性奖金
全年一次性奖金包括年终加薪、实行年薪制和绩效工资办法的单位根据考核情况兑现的年薪和绩效工资。
计算适用税率和速算扣除数
将雇员当月内取得的全年一次性奖金除以12个月，按其商数确定适用税率和速算扣除数。
代扣代缴
扣缴义务人（通常是单位）在发放奖金时代扣代缴个人所得税。
特殊情况处理
如果在发放年终一次性奖金的当月，雇员当月工资薪金所得低于税法规定的费用扣除额，应将全年一次性奖金减除“雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额”后的余额，再按上述办法确定全年一次性奖金的适用税率和速算扣除数。
纳税方式选择
居民个人取得全年一次性奖金，也可以选择并入当年综合所得计算纳税。
建议：
单位在发放绩效工资时，应严格按照上述规定计算税款，并及时完成代扣代缴工作，确保员工个人所得税的正确缴纳。同时，员工也应了解自己的纳税义务，确保个人税务信息的准确无误。