公司发放薪资的程序主要包括以下几个步骤：
选择代发银行并签订协议
公司需要选择一家银行作为代发工资的银行，并与该银行签订代发协议。协议中会明确双方的权利和义务，包括工资发放的时间、方式、金额等细节。
准备工资发放所需信息
人力资源部门（HR）需要收集和核对员工的上个月出勤记录、增减项等信息，确定本月工资结构，并计算每个员工应付的工资数额。
计算工资总额
HR经理需要计算出员工实际应发的总金额，包括基本工资、绩效工资、加班费等项目，确保计算的准确无误。
下达支付指令
HR经理将支付指令下达给财务部，将员工应发的总金额发放到公司指定的账户中，并确保每个员工应发的金额发放到正确的账户。
工资发放
财务部在每月规定的时间将工资批量转入员工的银行卡中。如果公司的基本账户不在代发银行，财务部门需要将资金划入代发银行的指定账户，待资金到账后，银行会按照收到的数据将工资批量转入每张工资卡。
核实和记录
HR经理需要核实工资发放的准确性，并记录发放结果，确保员工能顺利收到正确的工资。
法律合规
公司在发放工资时，必须遵守《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，确保工资按时足额支付，不得克扣或无故拖欠劳动者的工资。
建议
选择合适的银行：公司应根据自身需求和银行的服务质量选择合适的代发银行，确保代发过程的顺畅和高效。
确保信息准确：HR部门在收集和计算工资信息时，务必仔细核对，避免出现错误，确保员工能够按时收到应得的工资。
遵守法律法规：公司应严格遵守相关法律法规，确保工资发放的合法性和合规性，维护员工的合法权益。