种鸭的免疫程序包括以下步骤：
雏鸭群免疫
3日龄左右，使用病毒性肝炎活苗进行皮下注射免疫。
7~14日龄时，使用鸭疫里默氏杆菌病灭活苗或鸭疫里默氏杆菌病、大肠杆菌病二联灭活苗进行免疫，每羽皮下注射0.5毫升。
仔鸭群免疫
在第一次用Ⅱ号剂型灭活苗免疫1个月后，再用Ⅰ号剂型灭活苗免疫，或在第一次用Ⅰ号剂型灭活苗免疫1.5~2个月后用再Ⅰ号剂型灭活苗免疫，每羽肌肉或皮下注射1毫升。
种鸭群免疫
鸭流感灭活苗免疫：
产蛋前2~4周用Ⅰ号剂型灭活苗免疫，每羽肌肉注射1.0~1.5毫升。
产蛋中期免疫：在产蛋前免疫后2个月左右再进行一次免疫，每羽肌肉注射1~1.5毫升Ⅰ号剂型灭活苗。
禽霍乱灭活苗免疫：按常规免疫。
鸭瘟活苗免疫：按常规免疫。
雏鸭病毒性肝炎活苗免疫：种鸭群在产蛋前2周用该活苗免疫，免疫后120天内炕孵的雏鸭群对该病有较高的保护率。
其他补充免疫
在鸭子孵化后的第一天，进行皮下注射鸭病毒性肝炎弱毒疫苗。
在10日龄左右的鸭子，进行肌肉注射首次鸭瘟弱毒疫苗。
在鸭子孵化15天后，进行皮下或肌肉注射双价禽流感灭活苗，55天日龄时进行二免，蛋鸭在110天进行三免。
建议根据具体鸭场的情况及使用的疫苗，制定最适合自己的免疫程序，并严格按照免疫程序要求操作，以确保鸭群的健康和产蛋质量。