名誉损失认定程序通常包括以下几个步骤：
起诉
向有管辖权的法院立案庭递交诉状，提出诉讼请求和事实理由。
立案审查
法院在接到诉状后，进行立案审查，符合立案条件的，通知当事人7日内交诉讼费，交费后予以立案；不符合立案条件的，裁定不予受理。如果对裁定驳回起诉不服，10日内向上级人民法院提出上诉。
送达与答辩
受理后，法院5日内将起诉状副本送达对方当事人，对方当事人15日内进行答辩，通知当事人进行证据交换。
排期开庭
提前3日通知当事人开庭时间、地点、承办人；公开审理的案件提前3日进行公告。
开庭审理
法院将依照法定程序进行审判。原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以按撤诉处理；被告反诉的，可以缺席判决。
宣判
开庭审理后，法院将依照法定程序进行审判。判决宣告时公开进行，但是否当庭宣判则视法庭审理情况及结果而定。当庭宣判的，判决书须在五日内送达当事人及提起公诉的人民检察院。
执行
不服判决的当事人可在判决书送达之日起15日内向上一级人民法院提起上诉。上诉期满未上诉的，判决书发生法律效力。一方拒不履行判决的，另一方可以申请法院强制执行。
以上是名誉损失认定的一般程序，具体情况可能因案件细节而异。建议在实际操作中，当事人应咨询专业律师，以便更准确地维护自己的合法权益。