犯罪分子被捉拿归案后，将依照以下程序进行处理：
立案阶段 ：公安机构或其他具有管辖权的机关在发现存在犯罪事实或可追责的犯罪嫌疑人后，会启动刑事诉讼程序。侦查阶段
讯问嫌疑人：
公安机关会对嫌疑人进行讯问，同时询问被害人、证人，并收集其他相关证据，如书证、物证等。
采取强制措施：若证据充分，公安机关将对犯罪嫌疑人采取刑事拘留或逮捕等强制措施，并通知家属。
继续侦查：若需逮捕，则向检察院提请批准逮捕，并在批准后继续侦查。侦查期间一般为2个月，但可因情况延长。
审查起诉阶段
移送检察院：侦查结束后，公安机关将案件移送检察院审查起诉。检察院将审查证据和案件情况，决定是否提起公诉。
补充侦查：检察院在审查起诉期间可退回补充侦查，最多2次，每次1个月，重新计算审查起诉期限。
审判阶段
提起公诉：检察院在审查结束后，若决定提起公诉，将向法院移送案卷。法院将审查案件并进行开庭审理，最终做出裁决。
审判期限：法院审判期限通常在2—3个月之间，但可因情况延长，且检察院可申请延期审理。
执行阶段
判决执行：法院做出判决后，将依照判决执行刑罚。若判处监禁，将送交看守所执行。
在整个过程中，犯罪嫌疑人有权聘请律师作为辩护人，以维护自身合法权益。