特派办的工作程序一般包括以下几个步骤：
项目启动与方案制定
在审计项目开始前，会制定项目方案，明确审计的目标、范围、内容以及所需资源。
组成审计组，确定组长和成员，明确各自职责。
提前向被审计单位发送审计通知书，明确审计事项和需要提供的资料。
进场准备与沟通协调
审计组进场前，会先学习了解审计方案和项目的相关资料和法规。
召开进点会，与被审计单位沟通协调各种问题，提出进一步的资料要求。
审计实施
审计组长会安排审计组的工作，按照审计方案进行审计。
审计过程中，审计组会进行实地调查、查阅资料、询问相关人员等，以获取审计证据。
对于跨区域涉税违法案件，特派办会进行协调，以便多个地方的税务部门配合。
报告与反馈
审计结束后，审计组会编写审计报告，对审计结果进行总结和分析。
向被审计单位反馈审计发现的问题，并提出整改建议。
将审计报告上报给上级部门或相关领导，以便进行决策和后续处理。
后续跟踪与监督
对被审计单位整改情况进行跟踪和监督，确保问题得到彻底解决。
对于重大涉税违法案件，特派办会进行后续的稽查和处理工作。
这些步骤体现了特派办在审计工作中的系统性、规范性和专业性，旨在提高征管效率，堵塞征管漏洞，维护国家财政经济秩序。