软件系统可以申请多种类型的专利，以保护其技术创新和外观设计。以下是软件系统可以申请的专利类型：
发明专利
保护软件中的新技术、新方法、新装置等发明性创新。
可以保护软件系统的功能模块组成、软件控制方法等。
需要满足新颖性、创造性、实用性等要求。
实用新型专利
保护软件中的实用新型设备、工具、组件等新型实用性设计方案。
适用于保护具体实施方式或算法，如新的排序算法或数据结构。
申请周期短，审查标准相对较低，但保护期限较短，通常为10年。
外观设计专利
保护软件中的图形界面、图标、按钮、页面布局等的外观设计。
适用于保护用户界面设计，如独特的菜单布局或操作流程。
保护期限为15年。
软件算法专利
保护特定的计算方法、数据处理算法等，若该算法具有创新性且能带来技术效果。
软件架构专利
保护软件的整体结构设计，如分层架构、分布式架构等，当这种架构设计带来显著的技术优势或解决了特定技术问题时，可申请专利。
人机交互界面专利
保护软件的用户界面设计，包括界面的布局、交互方式等，以防止他人模仿。
数据库相关专利
保护数据库的结构设计、数据存储与检索方法等，若具有创新性和实用性。
软件与硬件结合专利
当软件与特定的硬件设备结合在一起，实现特定功能时，可申请此类专利。
软件程序本身专利
保护特定功能的软件程序，例如一种用于数据分析的特定算法程序。
数据结构专利
保护软件中特定的数据结构设计，如数据库结构等，以确保数据的有效管理和处理。
在申请软件专利时，建议咨询专业的专利代理人或律师，以确保申请文件符合相关法规，并提高授权成功率。