核对开票软件和金蝶的数据，可以遵循以下步骤：
销项核对
确认开票软件中的销售数据与销项发票上的信息是否一致。
检查销售数据是否已正确录入并包含所有必要的信息，如客户名称、项目、金额等。
进项核对
核对开票软件中的进项数据与认证抵扣的金额是否相符。
对于待认证的进项发票，核对其是否与网上未认证或财务手中未认证的进项票据一致。
已交的进项税额应与纳税证明中的数据核对，未交的进项税额则应与申报表上的销售项减去进项税额后的结果进行核对。
数据一致性检查
检查开票软件和金蝶系统中的数据是否同步，如果不一致，需要找出原因并进行调整。
由于系统同步问题可能导致数据差异，建议定期进行数据备份和比对，确保数据准确性。
税额差异处理
如果发现税额有差额，首先按照开票软件中的数据申报缴纳增值税。
根据实际开出发票的数据进行账务处理，确保账目与实际交易相符。
对于因四舍五入等原因造成的税额差异，可以通过营业外调整的方式进行处理。
通过以上步骤，可以有效地核对开票软件和金蝶系统中的数据，确保财务数据的准确性和合规性。