微生物工程技术，也称为 发酵工程，是指 利用微生物的某些特定功能，通过现代工程技术手段，在生物反应器中生产有用物质或直接把微生物应用于工业生产过程的一种技术系统。该技术具有以下特点：
操作条件温和：
一般操作条件较为温和，适合多种微生物的生长和代谢。
原料来源丰富且价格低廉：
一般都是可再生资源，如农业废弃物、工业废水等。
自动调节过程：
过程反应以生命体的自动调节方式进行，无需过多的人工干预。
生产复杂高分子化合物：
能够容易地生产复杂的高分子化合物，并导入复杂基团，如酶、光学活性体等。
产物生物体本身污染较小：
生产产品的生物体本身也是产物，一般污染较小，符合绿色环保的要求。
应用领域广泛：
与化学工业、医药、食品、能源、环境保护和农牧业等多个领域关系密切，具有显著的经济效益。
微生物工程技术不仅涵盖了传统的发酵工程，还包括基因工程技术、转基因生物技术、合成生物学技术等现代生物技术的应用，通过对微生物进行改造，使其获得或增强某些特定功能，从而应用于环境治理、生物制造、医疗等领域。
综上所述，微生物工程技术是一种综合性的技术系统，通过利用微生物的特定性状和现代工程技术手段，在生物反应器中生产有用物质，具有广泛的应用前景和显著的经济效益。