MCGS主体程序主要包括 组态环境和运行环境两部分。
组态环境
组态环境是生成用户应用系统的工作环境，由可执行程序McgsSet.exe支持，其存放于MCGS目录中的Program子目录中。
在组态环境中，用户完成动画设计、设备连接、编写控制流程、编制工程打印报表等全部组态工作，生成扩展名为.mcg的工程文件，即组态结果数据库。
运行环境
运行环境是用户应用系统的运行环境，由可执行程序McgsRun.exe支持，其存放于MCGS目录中的Program目录中。
运行环境负责执行组态环境中生成的工程文件，完成实时监控和数据处理等功能。
这两个环境相互独立，同时又紧密相关，共同构成了MCGS主体程序的核心部分。