企业辞退员工的程序主要包括以下几个步骤：
认定员工严重违纪
用人单位需依据合法有效的规章制度认定员工严重违纪，且规章制度必须公示过才能对员工产生法律效力。
必须有证据证明员工严重违反规章制度，否则用人单位可能因证据不足而败诉。
履行通知工会和本人的程序
用人单位单方解除劳动合同前，应当事先将理由通知工会。
提前通知或支付代通知金
用人单位解除劳动合同，若需提前30日通知或支付代通知金作为补偿，则应遵循相关法律规定。
与员工沟通并办理离职手续
企业应安排与员工进行沟通，听取员工的意见和诉求，并就解除劳动合同的具体事项进行协商。
双方达成一致后，企业应协助员工办理离职手续，包括结算工资、缴纳社保、转移档案等，并向员工出具解除劳动合同的证明。
履行其他相关手续
企业还需为辞退员工办理团、工会组织关系和档案等转移手续，以及社会保险和公积金的转移手续。
支付经济补偿
用人单位依照《劳动合同法》有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，应在办结工作交接时支付。
出具解除劳动合同的证明
用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
处理员工申诉
被辞退的员工对企业作出的辞退处理不服的，可以在收到辞退证明书之日起的十五日内，向当地劳动争议仲裁委员会申诉。
企业应严格按照上述程序进行操作，确保合法合规，避免因程序不当引发劳动争议。