制菌种的基本程序通常包括以下几个步骤：
母种分离选育
采集种源：从野生或人工栽培群体中选择有代表性的优良菇体作为种源，要求八成熟，朵形圆正，肉质肥厚，无病虫害。
培养基配制：制备琼脂培养基（如PDA培养基），包括马铃薯、琼脂、葡萄糖和清水，并进行高压灭菌。
母种分离方法：采用孢子弹射法、组织分离法等方法进行分离，获得纯菌丝体。
原种制作
菌悬液或单孢子悬液制备：将母种制备成菌悬液或单孢子悬液，并进行梯度稀释。
分别平板的涂布与培育：将稀释后的菌悬液涂布到分别平板上，在28±0.5℃下培育6-8天，挑选单菌落进行传代。
F1斜面和F2斜面的培育：将合格的单菌落分别接种到F1斜面和F2斜面上，进行进一步培育和筛选。
栽培种制作
接种：将原种接种到栽培种培养基上，进行扩大培养。
培养：在适宜的条件下（如温度、湿度、光照等）进行培养，直至菌丝体生长旺盛，形成子实体。
保藏与复壮
菌种保藏：采用低温、冷冻、干燥等方法对菌种进行保藏，以保持其活性和稳定性。
菌种复壮：通过组织分离法、菌丝体复壮等方法对保藏的菌种进行提纯和复壮，确保其遗传特性的稳定性。
繁育
三级制种方法：按照母种、原种、生产种的程序进行繁育，确保菌种的纯度和产量。
这些步骤确保了菌种的遗传特性和生长性能，为食用菌的栽培和生产提供了高质量的菌种材料。建议在实际应用中，根据具体的菌种类型和生产需求，选择合适的分离和培育方法，并进行严格的实验操作和质量管理，以确保菌种的质量和稳定性。