建养殖小区需要按照以下程序进行：
养殖用地证明
到国土资源局办理，符合养殖用地的可以办理。
环评手续
到环保局办理，环保部门会考察，排污合格的养殖场可以办理。
规划意见
养殖场设计好建设图纸后，到规划局审核。
立案备案手续
到发改委办理，最好与村委会一起去。
动物防疫条件合格证
在畜牧局办理，防疫到位的养殖场可以拿到手。
养殖场备案登记手续
到畜牧局办理，登记一下即可。
生产经营许可证
先让村委会证明，然后到畜牧局审核，最后到工商局办理。
野生动物驯养繁殖许可证
取得生产经营许可证后，到畜牧局办理检疫证，再到林业局办理。
土地流转合同
先与村里或土地经营者签订土地流转合同，确定养殖用地性质及其范围。
养殖项目申请
向当地政府提出养殖项目申请，政府工作人员实地勘察后出具同意养殖项目的批复意见和适养区证明。
建设指标申请
经过县农委立项后，向当地国土部门申请建设指标，国土部门核准后出具证明，可能需要缴纳复耕保证金。
畜禽养殖发展规划书
向当地兽医畜牧局提交畜禽养殖发展规划书，经审核后出具符合养殖发展规划证明。
建议在建养殖小区前，先咨询当地相关部门，了解具体流程和所需材料，确保顺利办理所有证件。