Java应用程序是指使用Java编程语言编写的程序，它们可以在多个操作系统上运行。Java应用程序的基本结构包括一个或多个类，每个类中包含一个main方法，这个方法是程序的入口点。
Java应用程序可以包括桌面应用程序、Web应用程序、移动应用程序等。它们通过Java虚拟机（JVM）实现跨平台运行，使得Java代码可以在任何安装了JVM的设备上运行。
与Java应用程序相对的是Java Applet，它是一种运行于网页文件中的小型应用程序，用于增强网页的人机交互、动画显示、声音播放等功能。Java Applet和Java Application的主要区别在于运行方式不同：Java Application是独立运行的程序，而Java Applet是嵌入在网页中并通过浏览器运行的程序。
总结：
Java应用程序：使用Java编写的独立运行程序，可以在多个操作系统上运行。
Java Applet：嵌入在网页中的小型应用程序，用于增强网页的交互功能。