前置审批程序存在以下缺点：
增加商事主体的开业成本：
前置审批程序过多会导致商事主体在开业前需要支付各种费用，如租金、装修费用等，并且在无营利状态下支付这些费用，造成资源浪费。
降低经商信心：
由于前置审批程序繁琐，可能会挫败商事主体的经商信心，导致他们不愿意进行商业活动。
参考性低、指导性弱：
前置审批目录更新不及时，导致基层工商所在准入审查中容易发生漏洞和疏忽，如对新兴行业的核准登记把握不准，可能产生越权或违规审批等问题。
费用高、时间长、办证难：
申请前置许可文件或证件成本高，门槛高，时间长，部分审批互为条件，形成证、照矛盾，导致申请人和注册登记人员无所适从。
法律条文多且笼统，操作难度大：
涉及前置审批的法律规范和规范性文件繁多且笼统，难以操作，例如对危险化学品的界定不明确，导致难以确定是否需要办理前置审批。
缺乏沟通：
工商部门与前置审批部门之间缺乏有效的沟通联系，导致前置审批手续格式不统一，经营范围核定不一致等问题。
审批流程不科学：
个别行政许可项目设定不科学，如《安全生产许可证》对不同企业类型的要求不同，导致企业是否需要具备安全生产条件在产生经营活动前难以确认。
综上所述，前置审批程序存在诸多问题，影响效率，增加企业负担，并可能导致管理上的混乱和漏洞。因此，有必要借鉴其他国家的经验，优化审批流程，减少不必要的审批环节，以提高行政效率，促进商业活动的便捷和繁荣。