保护已经安装的软件可以通过以下几种方法：
使用专业工具
洞察眼MIT系统：管理员可以通过登录系统管理界面，开启软件安装控制策略，配置策略细节，如是否允许从特定源安装软件、是否需要管理员审批等。系统还能实时监控员工电脑的软件安装行为，并记录相关日志。此外，系统支持设置程序黑白名单功能，管理员可以根据需求创建允许或禁止运行的程序列表，一旦发现有违反黑白名单规则的行为，系统将立即触发报警机制。
利用Windows组策略编辑器
通过按Win+R键，输入`gpedit.msc`并按回车，打开组策略编辑器。导航至“用户配置”>“管理模板”>“系统”>“不要运行指定的Windows应用程序”或“计算机配置”>“管理模板”>“Windows组件”>“Windows Installer”，根据需要选择禁止运行或安装的选项，设置策略并应用。
修改注册表编辑器
注册表是Windows系统中存储配置信息的重要数据库。通过修改注册表，可以禁止某些软件的运行或安装。但请注意，这是一项高风险操作，操作前请务必备份注册表。
保持操作系统及软件更新
确保计算机操作系统及安装的软件保持最新版本，因为开发商在新版本中通常会修复已知的安全漏洞。更新操作系统不仅可以提高设备的安全性，还能增强对流氓软件的防御能力。
选择自定义安装选项
在安装新软件时，务必选择“自定义安装”选项，逐项确认需要安装的组件，从而避免意外安装不必要的流氓软件。
使用有效的防病毒和防恶意软件工具
现代防病毒软件通常具备实时监控和防护功能，可以在流氓软件试图安装时发出警告，帮助用户及时采取措施。定期运行全面病毒扫描以及更新病毒库，可以最大限度地提升计算机的安全性。
浏览器设置
用户可以在浏览器中启用弹出窗口拦截器，并选择适当的安全级别。在网络安全设置中，用户还可以选择禁用不必要的浏览器扩展和插件，保持浏览器瘦身，减少流氓软件入侵的可能性。
使用隐私保护工具
例如广告拦截器，可以有效抵御潜在的恶意广告。
及时清理潜在流氓软件
一旦发现可疑软件，应立即卸载，并使用专业工具进行深层扫描。系统的“程序和功能”列表中，可以查看已安装的软件，卸载不明来源或不常用的软件也是提升系统安全性的重要步骤。
加密已安装的软件
可以使用WinRAR等工具对已安装的软件进行加密，确保只有输入正确密码才能运行。
通过上述方法，可以有效地保护已经安装的软件，防止未经授权的安装和潜在的安全威胁。建议企业和个人用户根据自身需求选择合适的方法，并定期检查和更新安全策略。