软件著作查重的方法如下：
使用专业查重系统
可以选择中国知网（CNKI）、万方数据或维普网等专业的查重平台，这些平台能够全面检测作品内容的原创性，确保专著的原创性和独特性。
使用查重软件
可以使用Easy DupLicate Finder、EasyFileCount等查重软件，这些软件可以帮助用户找出重复的文件或内容，并提供批量处理的功能。
提前规划查重时间
在提交申请书前一个月左右开始查重，这样你有足够的时间修改和优化你的申请书。
使用多个查重系统
不同的查重系统可能会有不同的结果，所以最好使用多个查重系统进行比对，以确保结果的准确性。
注意查重报告
如果查重结果不符合要求，作者需要对专著进行修改，以降低重复率，直到满足出版社或评审单位的查重标准为止。
了解查重流程
一般来说，查重系统会自动对比你的申请书和已有的数据库中的软件作品，如果发现相似度过高，就会提示你可能存在抄袭风险。
准备查重材料
确保你的申请书资料完整，格式合乎要求，这样在查重过程中可以更顺利地通过形式审查。
通过以上方法，可以有效地进行软件著作的查重工作，确保作品的原创性和独特性。