软件著作权可以在中国版权保护中心官网上进行查询，也可以在小盾知识产权网上进行查询和办理登记申请。可查询的内容包括：登记号、作品名称、版本号、申请人、登记时间、发表时间等。查询到的作品名称一样，不属于侵权，因为标题一样，内容不同，均可能被判为独创而不构成侵权。但如果需要查询软件著作权的源代码和操作说明书，则需要另外提交查询申请表和提交相关的证明文件给到版权局，才可以进行查询。
中国版权保护中心是国家版权局认定的唯一的软件登记机构，负责全国计算机软件著作权登记的具体工作。著作权人或者代理人办理软件著作权登记可到中国版权保护中心的登记大厅现场办理，也可使用挂号信函或特快专递邮寄到中国版权保护中心软件登记部。
因此，软件著作权登记应在中国版权保护中心进行办理，申请人可以通过现场办理或邮寄方式提交登记申请材料。