创业公司在选择仲裁案件时，应考虑以下几类纠纷：
劳动纠纷
涉及劳动合同的订立、履行、变更、解除和终止等。
工资、工时、福利、社会保险、工伤赔偿等劳动争议。
合同纠纷
各类合同，如买卖合同、租赁合同、借款合同、保险合同等。
技术合同、著作权合同、商标许可使用合同、房地产合同等。
知识产权纠纷
涉及专利、商标、版权或商业秘密的纠纷。
公司纠纷
涉及公司治理、股东权利和董事责任的纠纷。
合伙纠纷
涉及合伙关系协议的解释、履行或解散的纠纷。
其他财产权益纠纷
涉及侵权产生的财产权益纠纷。
劳动争议
包括确认劳动关系、工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护等。
建议
创业公司在选择仲裁案件时，应优先考虑仲裁的效率和成本效益。劳动纠纷和一般合同纠纷是创业公司常见的仲裁案件类型，建议优先选择这些类型的纠纷进行仲裁。同时，考虑到知识产权和公司纠纷可能涉及复杂的法律问题，建议在必要时寻求专业法律人士的帮助。