公司发放工资的程序通常包括以下几个步骤：
工资计算
工资由基本工资、绩效工资、奖金、补贴等部分构成。
不同公司有不同的计算方式，员工在入职前应与公司确认工资构成。
工资发放流程
银行代发：
公司选择银行代发工资，减少人工操作风险，提高效率。
财务部门录入员工工资信息并进行核对。
财务审核：
在工资发放前，财务部门需审核工资信息的准确性和完整性，包括社保、公积金、个税等扣缴情况以及工资数额。
员工确认：
员工收到工资后，如有问题应及时与财务部门沟通。
法律依据
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠。
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，用人单位应按劳动合同约定和国家规定，及时向劳动者足额支付劳动报酬。
其他注意事项
用人单位必须书面记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者姓名及签字，并保存两年以上备查。
公司发放工资时，可以向劳动者提供工资条，员工如有异议可及时提出。
综上所述，公司发放工资的程序主要包括工资计算、财务审核、银行代发、员工确认等步骤，并且需遵守相关法律法规，确保工资支付的准确性和及时性。