在农田上建房需要遵循以下程序：
申请
农村村民首先需向集体经济组织提出建房申请，并提供必要的材料和证明。
公示
村集体经济组织会将申请建房户张榜公示在醒目的地方，公示期通常为15个工作日以上，以确保透明度和公正性。
初审
国土资源管理处及镇社会事务办公室的工作人员会到实地进行考察，对申请人是否符合条件以及拟用地是否符合规划方面等进行初审。
审核与审批
公示期满且没有异议后，将符合条件的用地户按照规定报乡镇人民政府进行审核，再报县人民政府审批。如果涉及占用农用地，则需按规定报到市政府办理农用地转用审批手续。
办理手续
在获得政府批准后，需要办理一系列手续，包括选址意见书、规划许可证和施工许可证等。
建设过程管理
镇政府会进行现场查验，实行建设全程管理，确保建房过程符合相关规定。
竣工验收
村民住宅建成后，国土资源所会到实地检查是否按批准面积和要求使用土地，对符合要求的建房户核发集体土地使用证书。同时，建房户需要申请竣工验收，核发建房竣工验收合格证。
注意事项：
如果水田列入基本农田保护范围，需要建房的，必须逐级审批，最后经国务院批准后才能建房。
如果没有列入基本农田保护范围的水田，经村民小组、村民委员会、当地乡政府批准后，报国土资源局对其进行审批即可。
在农田上盖房子需要经过严格的审批程序，确保符合当地政策和法规。整个过程包括选址、申请、审批、设计、建造和验收等环节。
以上程序仅供参考，具体操作过程中可能会因地区和具体情况有所不同，建议咨询当地相关部门获取详细指导。