转厂报关的程序主要包括以下几个步骤：
准备相关文件
合同
发票
提单
装箱单等
办理转厂手续
将货物从原厂运输至目标厂，包括货物申报和转运单据办理等
报关申报
根据转运单据和相关文件，填写报关单和申报表，准确描述货物的品名、数量、价值等信息，并提交给海关进行报关
海关查验
海关会对报关的货物进行查验，以确保货物真实合规。在查验过程中，有可能需要提供更多的文件和证明材料
缴纳关税
根据货物的品类和价值，需要向海关缴纳相应的进口或出口关税
办理放行手续
在海关查验合格且关税缴纳完成后，货物即可办理放行手续，进入目标厂或离境
办理结转报关手续
每批实际发货（收货）后90日内，在转出地、转入地海关办理结转报关手续
备案和审核
转出企业凭登记手册、申请表向转出地海关申请备案，海关审核包括派员下厂核查
转入企业在转出地海关备案之日起20日内，持申请表其余三联，填制本企业的相关内容后，向转入地海关办理备案手续并签章
收发货登记
转出和转入企业将实际结转情况在登记表进行登记，并加盖企业结转专用章
结转报关
转出、转入企业分别在转出地、转入地海关办理结转报关手续。转出企业实际发货后，在90日内办结该批货物的报关手续。转入企业实际收货后，在90日内办结该批货物的报关手续
建议企业在进行转厂报关时，提前准备好所有必要的文件，并严格按照上述步骤操作，以确保流程顺利进行并符合海关规定。