选择指令审理的最佳程序取决于案件的性质、复杂程度以及法律规定。以下是相关法律规定及适用情况的概述：
普通程序
适用范围：适用于案情较为复杂，需要详细审理的案件。
审理期限：应在立案之日起六个月内审结，特殊情况下可延长六个月。
简易程序
适用范围：适用于案情简单，不存在被告下落不明等情形的案件。
审理期限：应在立案之日起三个月内审结。
指令再审程序
适用范围：最高人民法院或上级人民法院发现下级人民法院的判决或裁定确有错误时，可指令再审。
审理程序：再审程序将依照原审程序进行，但第二审人民法院不得再次发回重审。
建议
选择程序：根据案件的具体情况选择合适的审理程序。如果案情简单且迅速审结更为重要，简易程序是更好的选择；若案情复杂，需要更详尽的审理，则普通程序更为适用。
注意时限：无论选择哪种程序，都应注意审理期限，确保在法律规定的期限内完成审理。
遵循法律规定：在审理过程中，应严格遵守相关法律规定，确保程序合法、公正。
通过以上分析，可以根据案件的具体情况选择最合适的指令审理程序，以确保案件的公正、高效审理。