清明节祀祖程序主要包括以下几个步骤：
择日
清明节祭祖应选择晴朗的上午，避免破日、破时或阴雨、昏暗的天气。农历闰二月也可以祭祖，心诚则灵，感通天地，祖宗不会害子孙。
清心
整理衣冠，庄严得体，不得嬉笑怒骂，不得胡思乱想，不得大声喧哗。集体祭祖需按长幼尊卑顺序整齐列队，庄严肃穆，列队前给每人发放一束鲜花、一支香。特殊时期不宜组织集体祭祖。
供养
年长者、祭祀活动主持人或自然风水师将五色豆、五色果、清水、香、灯烛、鲜花、纯素糕饼等供品摆放在墓碑前。供品中不得使用荤食、烟酒，也不得燃放鞭炮。
祭拜
在墓前跪地，按长幼顺序插香，每座坟前供三根香，口念祭词，感谢祖先并祈求祖先保佑家人后代平安顺遂。插香时从右向左，表示对祖先的尊敬。
上供品
供品包括水果、糕点等，摆放格式一般以三或三的倍数数量关系摆放，如三样、五样或九样，每样数量为三个、五个或九个。
烧纸、祭拜
在坟顶压好纸钱，焚烧元宝、纸钱等，并进行祈福。烧纸过程中要庄严肃穆，默念给祖先烧纸的原因和祈求事项。
叩首、放鞭炮
纸钱烧完后，开始叩首行礼祭拜。最后放鞭炮，象征红红火火。
清理
确保所有火熄灭后，进行最后的整理，收走垃圾，并按习俗处理供品。
其他习俗
有些人家会在清明节当天或前后时间在家里拜祭祖先，有些还会折嫩绿的新枝插在坟上，或在坟上压些纸钱，表示子孙已献给先人足够多的钱币。
这些步骤体现了清明节祭祖的庄重与感恩，同时也传承了中华民族的传统文化和习俗。