公司代账的程序通常包括以下几个步骤：
签订合同
客户与财务代理公司接触洽谈，签订代理记账协议书面委托合同，确定服务项目及费用、支付时间和方式等。
接票
每月的固定时间，客户提供原始单据，财务代理公司安排人员上门使用“交接清单”取单，或者通过其他方式如快递公司取单。
做账
财务代理公司根据客户要求，采用手工或电脑方式做账。做账过程一般要遵守录入和审核分开的原则，电脑做账一般要打印相应的会计资料给客户。
报税
根据各地税务机关的要求，财务代理公司安排人员负责纳税申报工作。现在一般都是采用网上纳税申报的形式，有些特殊情况需要财务人员去税务局办理。
回访
财务代理公司返回税单、财务报表、纳税申报表等会计资料，与出纳对账，安排下月工作。
其他服务
代理记账公司还可能提供税务政策传递、日常电话答疑、定期电话或上门回访等服务，帮助企业解决财务和税务问题。
以上是一般公司代账的基本程序，具体流程可能因地区和公司具体情况有所不同。在选择代账公司时，建议企业仔细考察其资质和服务内容，确保选择到合适的合作伙伴。