程序：
程序是为完成某项活动所规定的方法。在计算机科学中，程序是一系列按照特定顺序组织的计算机指令和数据，用于实现特定功能或解决特定问题。程序可以通过编程语言编写，并通过编译器或解释器转换成计算机可以执行的代码。
文件：
文件是在计算机中存储数据的一种结构，用于记录信息以便长期保存和后续使用。文件可以由文本、图像、音频、视频等多种类型的数据构成，并通过文件名、图标等信息进行识别和管理。文件是计算机系统中不可或缺的组成部分，用于存储、检索和传输数据。
程序文件：
程序文件是存储计算机程序的特定类型的文件，它包含了程序的源代码、目标代码、配置信息和其他相关数据。程序文件的主要作用是定义和记录计算机程序的结构、逻辑和行为，以便于程序的编译、链接、执行和维护。常见的程序文件格式包括源代码文件（如.c、.cpp、.java等）、目标代码文件（如.exe、.dll等）和脚本文件（如.py、.js等）。
在质量管理体系中，程序文件是质量手册的支持性文件，用于详细规定某项工作的一般过程，确保质量活动受控并符合规定的要求。
总结：
程序：是为完成特定活动而规定的方法，由指令和数据构成。
文件：是计算机中存储数据的结构，用于记录和保存信息。
程序文件：是存储计算机程序的特定文件类型，包含源代码、目标代码等，用于定义和执行程序。