地铁的程序制动是指 根据事先设定好的启动程序，依次施加制动。地铁的制动优先级别为再生制动、电阻制动和空气制动。在正常制动情况下，电制动（再生制动和电阻制动）优先使用，空气制动则作为补充，即空电联合制动。在紧急停车情况下，紧急制动完全由空气制动提供。
具体来说，地铁在接近停车位置时，会经过地下的线圈，触发ATO（自动列车驾驶系统）对应的制动程序，开始分阶段降低列车速度。当列车收到最后一个停车信息后，ATO系统会将刹车踩到底，确保列车准确停在对应屏蔽门位置，误差不超过30厘米。ATO系统的存在极大地减少了司机的工作量，但它并不能完全取代司机。