软件出口退税的办理流程如下：
准备相关材料
出口软件的销售合同和发票等证明材料。
软件产品备案证明，如软件著作权登记证书或软件产品备案登记证书。
进出口合同复印件。
发票原件或复印件。
企业营业执照和税务登记证等相关证明文件。
提交申请
登录电子口岸网站，提交软件出口退税申请。
填写退税申请表并附上相关文件，如报关单、核销单等。
将所有材料提交至当地所在区县税务机关。
等待审核
税务机关收到申请后，进行资料审核和实地核查。
审核通过后，发放退税凭证，并将税款退还至企业指定账户。
注意事项
退税申请中需注意材料完整性和准确性，确保符合要求以避免审核失败。
若有疑问或遇到困难，可咨询税务部门或专业服务机构。
具体步骤总结：
1. 准备所有必要的出口文件和证明材料。
2. 登录电子口岸网站，提交软件出口退税申请。
3. 填写退税申请表并附上所有相关文件。
4. 将所有材料提交至当地税务机关。
5. 等待税务机关审核，审核通过后退税款项将退还至企业账户。
建议企业在办理软件出口退税时，提前准备好所有相关材料，并详细核对，确保信息的准确性和完整性，以减少审核过程中可能出现的问题。