生物信息有哪些软件

时间:2025-03-30 14:06:55 软件教程

一、综合分析平台

百迈客生物云平台

- 支持数据挖掘与项目管理,提供可视化界面和硬件资源保障,适合科研团队快速完成生信分析。

Singulariry

- 基于Docker技术,支持快速部署生物信息分析环境,适合需要灵活配置的场景。

二、序列分析工具

Clustal系列

- 包括图形化界面版本(Clustalx)和命令行工具(Clustalw),用于蛋白质/核酸序列比对和进化分析。

RasTop203

- 专为RasMol271设计的图形用户界面工具,简化3D分子结构可视化操作。

三、数据库资源

NCBI数据库

- 提供GenBank、BLASTN、Protein等核心数据库,支持序列比对、基因预测及蛋白质结构分析。

ArrayVision 7.0

- 商业基因芯片分析软件,集成图像处理与数据管理功能,适用于基因表达谱分析。

四、基因组与蛋白组学工具

YeastGenome

- 移动应用,用于可视化人类基因组序列,辅助分析序列变异及拷贝数变化。

Proteome Analyzer

- 支持蛋白质结构预测、亲水性分析及蛋白酶切位点预测,集成多种生物信息学功能。

五、移动应用

DNAApp

- 可查看和分析DNA测序电泳图(.ab1文件),适合现场快速检测。

BioGene

- 提供基因功能查询服务,支持通过基因符号获取相关信息。

六、其他常用工具

In-Fusion:

支持基因融合分析,适用于基因工程及功能研究。

RNAdraw:Windows平台的多文档处理工具,用于RNA二级结构计算及文库管理。

ExPASy:在线工具,支持蛋白质分子量计算、亲水性分析及酶切位点预测。

七、专业领域软件

SnapGene:整合DNA分析功能,支持酶切位点设计及数据对比。

ArrayPro:用于微阵列数据分析,提供图像处理与统计分析功能。

以上软件及数据库覆盖了生物信息学的主要应用方向,可根据具体需求选择合适工具。例如,序列分析优先考虑Clustal或RasTop203,基因组学研究则侧重NCBI或ArrayVision。