软件合同中的权利主要包括以下几方面：
许可权限
乙方根据合同获得的使用许可软件的权利，包括但不限于安装、运行、复制等。
用户
指与本合同签订的乙方，以及乙方指定的合法使用者。
许可期限
本合同规定的许可软件使用期限，自合同生效之日起至合同约定的终止日期止。
费用
甲方收取费用，但保留对软件的所有权及其他权利。
保密条款
双方应对合同内容及履行过程中获知的对方商业秘密和技术秘密予以保密，未经对方书面同意，不得向任何第三方披露。
软件著作财产权
专有使用权：包括复制权、发行权、出租权、信息网络传播权、翻译权等。
使用许可权：软件著作权人享有的许可他人行使其软件著作权并获得报酬的权利，分为专有许可和非专有许可。
转让权：软件著作权人享有的全部或者部分转让其软件著作权并获得报酬的权利。
这些权利共同构成了软件合同中的核心内容，确保双方在软件使用、转让、保密等方面的权益和责任明确。建议在签订软件合同时，详细审阅并明确各项权利和义务，以避免后续纠纷。