开源化学软件包括以下几种：
ChemDraw：
这是一个专业的化学绘图和文档制作软件，广泛应用于化学教育和研究，可以创建各种化学结构式和反应方程式等。
Microsoft Excel：
Excel也可用于化学数据分析，特别是在处理大量数据时，通过使用公式和函数，用户可以进行各种计算，如平均值、标准差等。
Matlab：
这是一个强大的数学软件，用于算法开发、数据可视化、数据分析以及数值计算，在化学中，它常用于模拟和优化复杂化学反应过程。
Gaussian：
这是一个广泛使用的量子化学软件包，特别适用于处理具有复杂电子结构的分子和材料，可以预测分子的几何构型、能量、光谱等性质。
Orca：
这是一个商业化的化学软件，主要用于有机合成的设计和优化，它具有强大的反应构建功能和路径搜索算法。
ASE （Atomic Simulation Environment）：
这是一个开源的计算机模拟库，用于创建和操作各种物理系统，包括分子和固体物质。
PHREEQCPHREEQC Version 3：
由美国地质调查局（USGS）开发与维护，免费并开源，用于水文地球化学平衡与反应模拟。
Visual MINTEQ：
由瑞典皇家工学院开发，用于化学平衡和动力学反应模拟。
CDK （Chemistry Development Kit）：
这是一个结构化学信息学和生物信息学的开源Java库，提供了多种化学输入/输出文件格式、结构发生器、2D图表编辑和生成、3D几何图形生成等功能。
Avogadro：
这是一款开源的分子建模和可视化软件，提供了丰富的工具和功能，包括分子编辑器、3D渲染、量子化学计算等。
这些开源化学软件涵盖了从结构绘制、数据分析到模拟优化的广泛功能，可以满足不同用户在化学研究和实验中的需求。