一、专业医学图像处理软件
3D Slicer - 功能全面,支持颅骨去除模块(SwissSkullStripper),可自动剥离颅骨并生成颅骨模型。
- 提供ITK文件处理能力,兼容多种医学图像格式。
ITK-SNAP
- 用于3D医学图像分割,支持从CT或MRI文件中自动分割颅骨,可生成网格并注入Kong洞。
二、深度学习与图像处理工具
BrainTools (Python)
- 基于U-Net架构,实现颅骨剥离和FLAIR异常分割,适用于处理含噪声的医学图像。
BS公共数据集处理工具
- 提供基于深度学习的颅骨剥离算法,使用PyTorch实现,支持MRI和CT图像处理。
三、其他相关工具
MeshLab: 开源的3D网格处理工具,可进行颅骨网格清理、修复和孔洞注入等操作。 FSL (FMRIB Software Library)
四、注意事项
数据格式:优先使用DICOM格式的CT或MRI文件,若为NRRD格式需先转换。
阈值设置:部分工具(如3D Slicer的SwissSkullStripper)需手动调整颅骨分割阈值,建议参考医学图像处理指南。
以上工具可根据具体需求选择,例如3D Slicer和ITK-SNAP适合快速处理,而BrainTools和BS工具则更适合需要高精度分割的研究场景。