工资软件在企业管理中发挥着重要作用，但同时也存在一些问题。以下是一些常见的问题：
人事档案管理混乱：
传统管理方式下，人事档案管理往往比较混乱，查询困难，容易出现劳动合同逾期未签、保险未能及时办理、档案资料无从查找的情况。
薪资计算复杂：
薪资、福利计算以及扣减项目繁多，每月因人员变动和升降，相关人员需要不断计算，且容易出错。所得税、社保等项目的扣减、变化，税率的设置、缴费金额、计时计件工资的核算等都非常复杂，有时甚至因为计算错误而拖延工资的发放。
绩效考核难以实现：
企业的绩效考核难以实现，尤其是将一些定性的指标量化，无法对员工的表现进行考核和记录，导致员工的真实绩效状况无法反映，往往只能凭上级的印象和观察，这样可能会让一些大问题不能及时反映。
系统功能不全面：
有些工资软件只包括工资发放的统计，其他如工作业绩核算工资等功能没有，无法满足企业的全面需求。
操作复杂：
一些工资软件操作复杂，需要一定的学习成本，对于一些小型企业或员工来说，可能会带来额外的负担。
数据安全性：
工资软件涉及大量员工个人信息和财务数据，数据安全性是一个重要问题。如果系统安全措施不到位，可能会导致数据泄露或被篡改。
定制化需求：
不同企业的管理需求和流程各不相同，一些工资软件可能无法满足企业的定制化需求，需要额外的定制开发，增加了成本和使用难度。
更新和维护：
工资软件需要定期更新和维护，以适应法律法规的变化和企业需求的变化。这需要企业投入额外的时间和资源。
综上所述，企业在选择工资软件时，应综合考虑软件的功能、易用性、安全性和成本等因素，选择最适合自己的解决方案。同时，企业也应定期对工资软件进行评估和优化，以确保其能够持续满足企业的发展需求。