软件证书的办理流程主要分为软件产品登记证书和软件著作权登记证书两种。
软件产品登记证书
准备工作
拥有完整的软件产品，包括程序代码和产品说明书。
申请软件著作权登记证书，以证明软件归公司所有。
提交申请
在线填报软件产品登记申请，并提交纸质材料，包括：
软件产品登记申请表。
企业法人营业执照副本和复印件。
软件著作权证书。
形式审查和实质审查
政府相关部门对提交的资料进行形式审查，确认资料是否齐全且符合规定格式。
实质审查审核软件产品的技术内容、功能特性、版权状况等。
备案和领取证书
部分地方可能要求已登记的软件产品还需到相关部门进行备案。
完成所有审查和备案流程后，可以领取软件产品登记证书，有效期为五年，有效期满后可申请续延。
软件著作权登记证书
确定申请方式
可以自己申请，也可以找专业版权代理服务机构代办理。
如果不着急用证书，可以自己办理，费用为0，2-3个月下证；如果着急用证书，可以加急，50天左右下证，费用可私信。
准备申请材料
软件基本信息：包括软件名称、版本号、开发完成日期、开发及运行环境、软件功能介绍、著作权人信息等。
软件文档：包括用户手册或详细设计说明书。
代码文档：提交软件源代码的前1500行以上和后1500行以上，共3000行以上源代码。如果全部源代码少于3000行则提供全部源代码。
2020年8月底开始中国版权保护中心施行了著作权人实名认证流程，必须通过实名认证后才能申请软件著作权，如果尚未实名认证，需要在中国版权保护中心官网注册账号提交实名认证信息，认证官方审核时间为1-3个工作日。
生成申请表
通过实名认证账号登录版权中心出具软著申请表。
如果是找代理机构办理，则可省略该步骤，全部由代理机构处理。
递交盖章材料至官方
单面打印签章页，在申请人盖章处加盖公章。
递交的材料包括：
盖章的申请表。
申请人的主体资格证明资料。
计算机软件源代码的前30页和后30页（如果不足60页，应当全部提交）以及权属证明材料。
受理和审查
著作权登记文件初步审查通过后，版权保护中心会受理，根据目前的政策，国家是免收计算机软件著作权登记的费用的。
版权保护中心会根据《计算机软件保护条例》和《计算机软件著作权登记办法》的规定进行审查，审查通过的，予以登记；不符合规定的，发放补正通知。
领取证书
审查通过后大概30到60日就可以领取著作权登记证书。
建议
自己办理：如果时间充裕且对流程熟悉，可以选择自己办理，这样成本较低。
代理服务：如果时间紧迫或对流程不熟悉，建议选择专业版权代理服务机构，虽然会收取一定费用，但更加省事且能更快拿到证书。