软件报废处置的流程如下：
申请
使用科室负责人填写《软件报废申请表》，说明报废原因和意见，经分管院领导同意后报信息科。
论证
信息科组织信息工程技术专业人员、财务科、使用科室三方对申请报废的软件进行论证，确定是否符合报废标准。
单价10万元以下的软件，组织1名信息工程技术专业人员进行鉴定；
单价10万元及以上50万元以下的软件，组织3名信息工程技术专业人员进行鉴定，其中1名副高及以上职称；
单价50万元及以上的软件，组织5名信息工程技术专业人员进行鉴定，其中至少有2名副高及以上职称。
公示
拟报废软件面向全院在内网公示一周。
审批
经论证、公示符合报废标准的软件，由信息科报分管领导同意后，送医院行政领导班子会议和医院党委会审批。
处理
审批通过后，由信息科负责组织对报废软件进行清理、卸载、存储和处理，报财务科进行医院无形资产下账。
归档
报废软件的申请、论证、公示、审批和处理过程必须进行归档保存，以备后续查验。
报废软件必须进行彻底的清理，确保科室业务电脑不含有任何敏感信息和个人数据。报废软件存储和处理必须符合相关法规和规定，确保不造成环境污染和资源浪费。报废软件处理前必须进行登记和记录，确保可追溯性。涉及到医院重要业务的软件报废，还需经过更为严格的审批流程。