新版税控软件的申报流程如下：
登录系统
打开税控盘软件，使用正确的用户名和密码登录到系统中。
选择申报功能
在系统主界面上，选择申报功能或发票管理功能，根据具体的申报类型选择相应的选项，如增值税申报、企业所得税申报等。
填写申报信息
根据系统提示，填写相关的申报信息，包括纳税人信息、申报周期、收入、扣除和计算等详细信息。确保填写的内容准确、完整。
核对和预览申报表
在填写完申报信息后，系统会自动生成申报表或报表总结，核对各项数据和金额是否正确，并对申报结果进行预览和确认。
提交申报
确认无误后，选择提交申报，将申报信息上传至税务系统。
清卡操作（如果适用）：
在完成报税操作后，根据系统提示进行清卡操作，以确保税控盘可以用于下一次的报税。
注意事项：
确保税控盘与计算机或设备的连接稳定和正常。
在进行网上申报前，可能需要先进行用户卡申报或U盘申报，具体操作步骤请参照相关软件的使用说明。
提交申报后，企业需要等待税务机关对申报表进行处理，如果信息正确且符合相关规定，则企业可以顺利通过零申报。
以上步骤仅供参考，具体操作可能会因税控软件版本和税务政策的不同而有所差异。建议在实际操作前，先仔细阅读软件内的操作手册或联系税务咨询服务以获取更详细的指导。