软件系统维护的收费方式可以多样化，主要根据以下几个因素来确定：
服务级别协议（SLA）
软件企业应与用户签订软件系统维护服务合同，该合同属于技术服务合同，其收入应视同自主知识产权软件产品的销售收入。
根据不同的用户要求，软件系统维护服务可以分为四个级别：
A级：软件企业派技术人员常驻用户，解决日常运行中发生的问题，每年的收费推荐价格为系统投资的15%，若低于软件开发人员的开发推荐价，则按软件开发推荐价。
B级：软件企业7*24响应，2小时到场，且每月派技术人员到现场进行软件系统性能调整，使之运行处于良好状态，每年收费推荐价格为系统投资的10%。
C级：软件企业7*24响应，2小时到场，每年收费价格为系统投资的5%。
D级：用户的应用系统发生问题，由软件企业派人维护，收费推荐价格为4000元/人*天。
按系统规模和维护内容收费
系统维护费的收费标准一般依据实际需求和维护内容来确定。常见的收费方法包括按月收费、按年收费和按次收费。
系统规模越大，所需的维护工作也相应增加，故此收费标准会相对较高。
维护内容范围越广，所需的人力和资源投入也会相应增加，故此收费标准也会相对较高。
按功能和技术收费
财务软件的维护费用取决于软件的大小、功能和技术，一般维护费一年大概在1000-2000元，定制服务费用取决于客户需求。
软件的维护通常按年收取，费用大概在1000元/年至几万元不等，具体费用也取决于软件的型号等因素。
按项目或按次收费
有些软件企业会按照合同金额的一定比例收取维护费，例如每年合同金额的10%左右。
也可以根据具体的维护任务或项目来收费，每次维护的费用可能根据任务的复杂度和所需时间来确定。
额外服务费用
除了基本的维护服务外，还可能包括软件升级费用、定制化开发费用以及培训和支持费用等。
这些额外服务的费用通常根据具体需求和工作量来计费，可能是一次性支付，也可能是周期性支付。
建议
明确需求：在签订维护服务合同前，用户应与软件企业充分沟通，明确维护内容、服务级别和预期效果。
选择合适的服务级别：根据企业的实际需求和预算，选择适合的维护服务级别，以确保获得性价比高的服务。
签订详细合同：合同应详细列出维护范围、费用结构、服务周期及责任划分等内容，以减少后期纠纷。
通过以上方式，软件系统维护的收费可以更加透明和合理，确保双方的利益。