运行新网站软件的安全措施包括：
使用安全的运行方式
在程序图标上单击鼠标右键，选择“运行方式”。
在弹出的对话框中选择“保护我的计算机和数据不受未授权程序的活动影响”，然后按确定键运行程序。这可以防止程序进行系统修改，如修改注册表文件。
以较低权限运行
避免以“Administrator”身份登录Windows XP操作系统。
在运行不太清楚底细的软件时，选择“下列用户”一项，并将运行身份从系统管理员改为较低权限的账户。
建立用户认证机制
使用用户名和密码或双因素认证来保护网站。
设置密码强度要求，包括密码长度、复杂度和有效期。
数据加密传输
使用HTTPS协议，通过SSL/TLS证书加密数据传输，防止数据被窃取、篡改或冒充。
安全的编程实践
对用户输入的数据进行严格的校验和过滤，避免使用动态SQL语句。
遵循安全的编码实践，包括输入验证、错误处理和安全编码。
定期安全评估和漏洞扫描
使用自动化工具进行漏洞扫描，如漏洞扫描器和Web应用程序防火墙。
结合人工审核和渗透测试，确保网站的安全性。
保持软件更新
定期更新网站的软件，包括服务器软件、应用程序、CMS、插件等，以消除已知的安全漏洞。
使用安全的第三方服务
验证服务提供商的信誉，使用安全的API和密钥管理方式。
备份数据
在安装新软件之前，备份电脑中的重要数据，以防数据丢失或损坏。
选择可靠的托管服务提供商
选择一家知名的、信誉良好的托管服务提供商，确保网站的安全性。
通过以上措施，可以有效提高新网站软件的安全性，保护网站免受各种网络威胁。