在上海登记软件版权证，可以参照以下步骤进行：
准备材料
软件源代码：需要提供前后各30页的内容。
软件说明书：应清楚描述软件的功能、使用方法以及技术实现过程。
申请人身份证明材料：包括身份证、营业执照等。
其他可能需要的文件：如著作权归属书面合同、项目任务书、原著作权人的许可证明、权利继承、受让或承受的证明等。
提交申请
可以通过中国版权保护中心的官方网站或前往其上海分中心进行提交。
填写软件著作权登记申请表格，并上传或递交相关资料。
缴纳费用
软件著作权申请需要支付一定费用，费用因申请的具体情况而异。
可以选择普通申请或加急服务，普通登记费用较低，加急服务费用较高。
审查和受理
提交申请后，版权保护中心会对提交的资料进行审核。
如果资料齐全且符合要求，通常会在30个工作日内收到受理通知。
领取证书
在申请受理后，版权保护中心会进行正式审查，通过后便会颁发软件著作权登记证书。
持证人可以合法地对外宣示自己对该软件拥有著作权。
此外，也可以选择委托专业的知识产权代理机构代为办理，流程会相对简便一些，例如：
选择代理机构
可以选择与小盾知识产权代理公司等专业机构签订委托合同。
递交资料
由代理机构递交资料，通常3个工作日可下发受理通知书，30个工作日可下发软件著作权登记证书。
证书寄送
代理机构会负责将软件著作权登记证书通过顺丰寄付给客户。
综上所述，无论是通过官方渠道还是委托代理机构，申请软件著作权登记都需要准备充分的材料，并按照规定的流程进行申请和提交，最终获得软件著作权登记证书。