公司购买软件的收费方式主要可以分为以下几种：
一次性购买：
企业支付一笔固定费用，获得软件的永久使用权。这种方式的优点是企业无需担心后续费用，软件成为固定资产，可以长期使用。缺点是初始成本较高，可能给中小企业带来资金压力，且后续的维护和升级可能需要额外支付费用。
订阅模式：
企业按月或按年支付费用，获得软件的使用权和更新服务。这种模式的优点是初始成本较低，企业可以根据实际需求灵活调整订阅计划，并且通常包括持续的技术支持和版本更新。缺点是企业需要定期支付费用，无法完全控制成本。
按用户数收费：
根据实际使用软件的用户数量来收费。这种方式灵活性强，企业可以根据自身需求逐步增加或减少用户数量，避免不必要的开支。通常，软件提供商会提供不同级别的用户套餐，企业可以选择适合自身需求的套餐。
按功能模块收费：
企业可以根据自己的需求选择不同功能模块，按模块收费。这种方式较为灵活，企业可以根据实际需求选择所需的功能模块，费用通常根据模块的复杂程度而定。
定制开发费用：
针对企业特定需求进行的软件定制开发，费用较高。这种方式适用于企业有特别的需求，需要软件供应商根据具体需求进行定制开发。
在选择软件收费方式时，企业应当充分评估自身的财务状况和长期需求，选择最适合自己的收费模式。对于中小企业而言，订阅模式和按用户数收费可能更为合适，因为它们能够降低初始成本并提供一定的灵活性。而对于大型企业或有特殊需求的企业，可能需要考虑一次性购买或定制开发的方式。