深圳企业出口软件主要有以下几种方式：
有介质出口
定义：以实体形式（如光盘、U盘、磁盘等介质）存储的软件产品进行报关出口。
流程：
1. 在软件出口合同正式生效后，企业需登录“软件出口合同登记管理中心”进行在线登记，并领取《软件出口合同登记证书》。
2. 准备相关单证，包括《软件出口合同登记证书》、《软件出口合同》（正本）、《出口收汇核销单》（外汇管理局发放）等。
3. 前往海关办理软件出口报关手续，海关依据相关法规办理通关手续。
4. 完成收汇后，银行出具《出口收汇核销专用联》，企业凭此联及相应单证到外汇管理局办理出口收汇核销手续，并出具《出口收汇核销单退税专用联》。
5. 最后，企业凭所有相关单证到税务局办理出口退税手续。
无介质出口
定义：通过网络传输的方式进行的出口，不需要通过海关的报关流程，因为不存在物理货物的跨境移动。
流程：
1. 企业在与海外客户签订软件出口合同时，需明确软件进出口的传输方式，选择“海关通关方式”或“网上传输方式”。
2. 对于选择“网上传输方式”出口的软件，企业无需进行海关报关手续，但需确保合同和传输方式符合相关法律法规。
使用关务信息化软件
优势：
自动化数据处理与核对，减少人工操作错误。
报关流程自动化管理，提高效率。
数据可视化与智能分析，提供决策支持。
选择建议：
企业应选择功能全面、稳定性和安全性高、服务与支持好的关务信息化软件，如云关通智能报关系统，以满足日常进出口报关需求。
建议：
明确出口方式：企业应根据实际情况选择有介质或无介质出口方式，并明确合同传输方式。
准备齐全单证：无论何种出口方式，企业都应提前准备好所有必要的单证，确保报关和退税流程顺利进行。
选择合适的软件：企业应选择功能全面、稳定性和安全性高的关务信息化软件，以提高报关效率和准确性。
关注政策变化：软件出口涉及多个政府部门，企业应关注相关政策变化，确保合规操作。