办理软件涉密资质需要遵循以下步骤和条件：
明确资质级别和类别
涉密信息系统集成资质分为甲级和乙级两个等级。甲级资质单位可以从事绝密级、机密级和秘密级信息系统集成业务；乙级资质单位可以从事机密级、秘密级信息系统集成业务。
满足基础条件
具有法人资格，在中国境内合法注册。
建立健全的保密管理制度和保密责任制度。
配备专门的保密管理人员和保密设施。
保证软件开发、应用、维护过程中的信息安全。
准备申请材料
企业基本情况、软件项目介绍、保密管理制度等。
《涉密信息系统集成资质申请书》及相关材料，如企业营业执照、章程、法定代表人身份证明等。
资本结构和股权情况、生产经营和办公场所产权证书或租赁合同、近三年集成业务合同清单等。
涉密集成业务场所和保密设施、设备情况、基本管理制度、保密制度以及保密体系运行情况。
提交申请
向当地保密行政管理部门提交申请，初审通过后，进行现场审查，包括场地、人员、制度等核实。
甲级资质申请单位应当向国家保密行政管理部门提交申请；乙级资质申请单位应当向工商注册地的省、自治区、直辖市保密行政管理部门提交申请。
审核与现场审查
国家相关机构对企业提交的材料进行审核，并可能进行现场审查。
审查通过后，上报至国家保密行政管理部门审批。
审批与发证
审核通过后，国家相关机构将颁发涉密资质证书。
年度审查
资质单位应当在《资质证书》颁发日期满一个自然年后的三个月内，向作出审批决定的保密行政管理部门提交《涉密信息系统集成资质年度审查申请书》及相关材料。
建议在申请前咨询专业的法律顾问或代理机构，以确保申请顺利进行，并符合相关法律法规的要求。