软件管理系统运行的一般步骤如下：
系统规划与需求分析
明确企业目标与需求，选择符合业务特性的软件管理系统。
通过工作坊、问卷调查等方式收集各部门需求，制定详尽的实施计划。
环境准备与数据整理
确保硬件基础设施满足系统要求，部署服务器及数据库。
清洗并标准化现有业务数据，为系统上线做准备。
系统配置与定制开发
根据企业流程定制软件模块，配置组织结构、权限管理及业务规则。
必要时进行二次开发，以增强系统的适用性。
数据迁移与系统测试
将整理好的数据导入软件系统，执行单元测试、集成测试及用户验收测试，确保各功能模块稳定运行，无数据丢失或错误。
培训与推广
对不同层级用户开展系统操作培训，确保员工熟练掌握新系统。
建立内部推广机制，鼓励全员参与，提升系统接受度。
上线与持续优化
择机正式上线软件系统，初期应设立支持小组，快速响应并解决运行中遇到的问题。
持续收集反馈，进行系统调整与优化，确保软件系统持续服务于企业战略目标。
对于具体的软件管理系统，如ERP系统，运行步骤可能会有所不同，但大体流程相似。以用友畅捷通ERP系统为例，运行步骤如下：
1. 安装用友畅捷通ERP系统管理软件工具，并确保服务器环境符合官方推荐配置。
2. 启动软件，使用管理员账号登录系统，进入主界面。
3. 根据企业需求设置基础数据，包括但不限于客户信息、供应商资料、物料清单等。
4. 配置业务流程，如采购订单处理、销售出库管理等功能模块。
5. 培训相关人员掌握日常操作技巧，确保各部门能高效协作。
建议在运行软件管理系统之前，详细了解软件的具体功能和操作方法，并根据企业的实际情况进行适当的配置和定制。同时，确保有足够的技术支持和培训，以便在系统运行过程中能够及时解决出现的问题。