开票软件服务费应计入 管理费用-办公费科目。具体会计分录如下：
1. 支付开票软件服务费时：
借：管理费用-办公费
贷：库存现金/银行存款等
2. 按规定抵减增值税应纳税额时：
借：应交税费-应交增值税-减免税款
贷：管理费用-办公费
建议：
在实际操作中，确保严格按照实际支付金额和税率进行会计分录，并在税务申报时将抵减的税额正确填入相关纳税减免栏次。
对于小规模纳税人，除了上述分录外，还需注意在抵扣时可能涉及到的营业外收入科目。