申报软件退税的流程如下：
收集资料
准备相关出口软件资料，包括合同、发票、出口报关单等。
确保所有资料的真实性和完整性，包括软件企业认定证书、软件产品登记证书、税务登记证、财务报表、增值税纳税申报表、销售合同和发票等。
登录电子口岸网站
提交软件出口退税申请。
填写退税申请表并附上报关单、核销单等文件。
线上备案
登录电子税务局，提交项目备案申请，内容涵盖项目核心信息、技术框架、预期效益等。
线下对接
将详尽的项目资料整理成册，递交给当地税务机关指定窗口。
梳理规范合同与发票，保证每笔收支清晰可溯、合法合规。
开展成本核算工作，明确各项开支明细，为后续退税、奖励核算提供精准数据支撑。
审核进度
提交申报后，实时关注审核进度，如有需要补充资料的情况，及时响应。
税务机关在收到申报材料后，会展开严格审核，可能要求企业提供进一步证明材料或进行现场核查。
退税款项
审核通过后，退税款项将汇入企业账户。
企业应及时核对退税金额，若有异议可与税务机关及时沟通解决。
持续跟踪与更新
定期查看税务部门的官方网站，了解最新的出口退税政策动态。
熟悉软件的各个功能模块，提高申报效率。
建议
确保资料完整：在准备申报材料时，务必保证材料的真实性与完整性，避免因资料缺失导致审核不通过。
及时关注政策变化：政策和软件功能可能会更新，企业应定期查看税务部门的官方网站，确保申报的合规性。
加强内部培训：企业应加强对财务人员的培训，使其熟悉申报流程和软件操作，提高申报效率。