在日本，有几个知名的网站和平台可以购买到二次元周边商品：
萌购：
这是一个安卓手机版的应用程序，汇集了丰富的二次元周边商品，网罗了全球各大知名电商的商品资源，可以淘二手、逛预售和看现货，正品保障，轻松交易，折扣多多。
日淘任意门：
这个应用程序支持日本主流网站如日亚、骏河屋等，一键下单支付宝就能付款，仓库有60天保存期，可以选择拼单也可以选择直邮到手上。
樱花1688代购：
这款软件可以用来代购国外品牌，可以看到最全的物流消息，货到哪了，一看便知，24小时都有专业客服在线。
buyee代购：
这个安卓客户端汇集了日本当地的商品资源，商品分类详细，可以按照所需商品类别查找，也可以直接搜索商品名称，购物方便。
あみあみ官网：
支持海外配送，可以购买到一些海外的商品。
乐天日亚：
日本最大的购物平台之一，商品种类齐全，包括动漫手办、漫画书等。
骏河屋：
著名的二手商品和动漫周边商店，支持海外配送。
亚马逊日本站：
商品种类齐全，从电子产品到日常用品都可以找到，适合购买正品商品。
Mercari：
日本非常流行的二手交易平台，适合以更低价格购买物品。
Rakuten乐天市场：
被誉为“日本的淘宝”，商品内容应有尽有，包括动漫手办、漫画书等，可以买到全新的日本手办和二手商品。
J-island Store：
专门售卖Jr.周边的线上商店。
animate：
日本最大的动漫、漫画、游戏及周边销售的连锁店，拥有100多家店铺，商品数量超过25万。
根据你的需求和购物习惯，可以选择上述平台中的任意一个进行购买。如果打算亲自去日本，也可以考虑去一些实体店如discunion、tower records、涩谷的disc union、HMV等店铺逛逛，可能会有意外的收获。