软件企业认证的申报流程如下：
软件著作权登记
需要在国家版权中心进行登记，提交包括采集卡和著作权人身份证明等相关资料。
软件评测
提供软件安装光盘、软件测试委托书及软件功能列表等资料。
在当地软件行业协会办理
注册企业需要在网上进行填报相关资料，包括公司名称、地址、组织机构代码等信息。
注册审核通过后，填报软件企业认定申请表、上传模板表格等。
等待审核，审核通过后预约交材料，初审通过等待发证。
向省级主管部门提出软件企业认定申请
提交《软件企业认定申请书》、企业开发及经营的软件产品列表、企业拥有的相关知识产权证明材料等。
市经济信息化委网站在线申报
登录市经济信息化委网站，在线填写《软件企业认定申请书》，并上传相关附件证明材料。
软件中心完成网上预审，企业完成网上申报并加盖公章。
市经济信息化委进行审查，并将通过认定的软件企业名单上报工业和信息化部。
公示与发证
工业和信息化部公示认定结果，无异议的予以备案，市经济信息化委公布认定结果并颁发软件企业认定证书。
建议：
提前准备：企业应提前准备好所有必要的材料，包括软件著作权登记、软件评测、财务报表等。
关注流程：密切关注认证流程中的每个环节，确保按时提交材料并跟进审核进度。
咨询专业机构：如有条件，可以咨询专业的软件行业协会或政府部门，获取更详细的指导和帮助。