软件企业认证一般需要向当地的软件行业协会或相关省级主管部门提交申请，并准备相应的材料。以下是具体的办理步骤和注意事项：
注册
企业需要在网上进行填报相关资料，包括公司名称、地址、组织机构代码、电话、联系人等信息，并在软件行业协会的网站上进行申报软件企业认定的用户名注册。
提交申请材料
企业需要向省级主管部门提交《软件企业认定申请书》及相关材料，包括营业执照、税务登记证、软件产品列表、知识产权证明、质量管理体系证明等。
审核
省级主管部门在20个工作日内对企业进行审查，必要时组织专家评审。
公示与备案
经认定的软件企业名单在工业和信息化部网站和“中国双软认定网”公示7个工作日，无异议后予以备案。
办理地点
北京：
软件著作权登记：全国软件著作权登记统一在北京国家版权中心办理。
软件检测：将软件安装光盘、软件测试委托书及软件功能列表等材料提交至指定的软件检测机构（可通过北京市软件行业协会查询相关检测机构信息）。
软件产品登记：向北京当地软件行业协会提交申请。
软件企业认定：向北京当地软件行业协会或相关机构提交材料。
上海：
企业需要在网上进行填报相关资料，并在软件行业协会的网站上进行申报软件企业认定的用户名注册。
云南：
企业想申请软件企业认定，需要先申请软件著作权，然后进行软件产品登记测试，拿到著作权证书和测试报告后，向所在地的软件行业协会申请。
建议
选择合适的办理地点：根据企业所在地选择合适的软件行业协会或省级主管部门进行申请。
准备齐全的材料：确保提交的材料完整、准确，以免影响认定结果。
及时关注审核进度：在提交申请后，及时关注审核进度，并按照要求补充或修改材料。
通过以上步骤，企业可以顺利完成软件企业认证，享受国家和地方政府规定的相关优惠政策。