程序是以 二进制编码的形式存放在程序存储器中的。程序是由一系列指令组成的，这些指令在计算机中以二进制形式存储，即由0和1组成的代码。存储器中的每个存储单元可以存放一串二进制码，称为一个存储单元的字长。程序存储器是计算机中用于存放程序代码的硬件设备，它可以是主存储器（如RAM）或辅助存储器（如硬盘、光盘等）。
当计算机运行时，中央处理器（CPU）会根据存储在程序存储器中的二进制代码逐条执行指令，从而完成特定的任务或计算。程序在存储器中的存放位置由地址确定，存储器中的存储单元按顺序排列，每个单元都有一个唯一的地址。
因此，程序是以二进制编码的形式存放在程序存储器中的，这是计算机硬件和软件系统的基础。