dnastar
类型：国产软件，免费软件
功能：支持DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理，具备基因查找和可视化序列编辑功能，广泛应用于医学领域。
Bowtie
类型：教育教学软件
特点：超快内存读取，适用于快速对齐短DNA序列到人类基因组。
DNASTAR
类型：多功能DNA序列分析软件
功能：提供DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理等功能。
SnapGene
类型：分子生物学软件
特点：模拟Clontech的In-Fusion克隆技术，便于设计引物，适用于Windows系统。
Vector NTI Suite
类型：分子生物学应用软件包
功能：包括NTI、BioPlot等软件，可以对DNA、RNA、蛋白质分子进行各种分析和操作。
Oligo 6
类型：引物设计软件
功能：可以完成各种引物和探针的设计与分析，具有高级功能如搜寻和设计引物序列。
NCBI BLAST
类型：序列比对工具
特点：虽然比对速度慢且结果不够直观，但在实际工作中广泛应用。
序列处理在线工具包
类型：在线工具
功能：提供序列比对分析、寡核苷酸属性计算等功能。
OligoCalc
类型：寡核苷酸属性计算器网站
功能：分析DNA/RN寡核苷酸序列的分子质量、解链温度等性质。
这些软件涵盖了从基本的DNA序列比对、引物设计到高级的序列分析和蛋白质结构预测等多个方面，用户可以根据具体需求选择合适的软件进行DNA分析。